工作原理不同
壓電式高解析噴碼機集成的噴頭上，由128或者更多個壓電晶體分別來控制噴嘴板上的多個個噴孔，通過CPU的處理，再通過驅動板輸出一連串的電信號給各個壓電晶體，壓電晶體產生變形，這樣油墨便從噴嘴中噴射出來，落在移動的物品表面，形成點陣，從而形成文字，數字或圖形。
熱發泡高解析噴碼機噴嘴采用半導體薄膜技術，利用激光制程和高精密深層技術形成多個直徑在50μm左右的噴孔，這些噴孔呈高密度排列，噴墨通過薄膜電阻器通電加熱，使油墨產生無數微小氣泡，氣泡以極快的速度聚為大氣泡并擴展，迫使墨滴從噴嘴噴出；在電阻無電壓時則停止加熱，無墨滴噴出。
小字符噴碼機的工作原理是在壓力作用下，油墨進入噴腔，噴腔內裝有晶振器，通過振動，使油墨從極小孔徑（一般為60微米）的噴嘴噴出后形成固定間隔點，通過CPU的處理和相位跟蹤，通過充電極的一些墨點被充上不同的電核，在經過幾千伏的高電壓磁場下發生不同的偏移，飛出噴頭落在移動的產品表面，形成點陣， 從而形成文字，數字或圖形。
應用領域不同
小字符噴碼機被廣泛應用于食品、飲料，日用品，醫藥，建材、管業，機械，電子，電線、電纜，包裝等行業。用途范圍包括包裝生產批次的噴印，化妝品生產日期的噴印，卡類的噴印，紙箱字符的噴印，圖案標識的噴印，部分二維碼和條形碼的噴印等。
高解析噴碼機廣泛應用于食品、藥品、日化、標簽噴印、制卡、包裝印刷、醫療、電子、五金等行業，由于高解析噴碼機的分辨率比小字符高，適合用于一物一碼，防偽溯源等領域的應用，識別率能達到100%。
其他一些不同
高解析噴碼機的噴嘴距離噴印物體的表面通常為3~10mm，如果是在凹面噴碼，有可能因為噴印距離太遠導致噴字不清晰，而小字符噴碼機的噴印距離可達到5-6cm；高解析噴碼機一般沒有行數限制，只要高度不超過噴印高度即可，而小字符噴碼機通常最多只能噴印3行；器原理的不同，高解析的干燥時間要比后者的干燥時間略長；高解析的速度通常在0-100m/分鐘，而后者的速度最快可達到200m/分鐘；由于高解析噴碼機在維護上比較省心，只需要定期清洗噴嘴，而小字符噴碼機則需要定期開機運行；此外，小字符噴碼機的墨水需要添加稀釋劑，并且有揮發性。
